建筑企业并购重组对于转型升级、拓宽产业链、优化资源配置等发挥着重要作用。在并购重组实施过程中存在诸多风险，导致部分企业的并购重组无法达到预期，甚至出现重组失败的情形。
1、信息失实风险 建筑企业并购重组的目的是为了占据更多的市场份额，进一步提高公司业绩。标的企业的财务状况、盈利能力、现金流量、偿债能力等将直接影响并购重组实施的效果。例如，若目标企业的作价较其账面净资产增值较多，则在合并报表中将会因此形成金额较大的商誉，根据现行会计准则，商誉需在未来每年年末进行减值测试，由于信息失实导致收购重组完成后经营出现不利变化，实际业绩未达到盈利预测水平，则可能出现商誉减值，企业的当期损益也会因此受到较大不利影响。
2、估值风险 合理估值是并购重组正式开始实施之前的关键步骤之一，对于并购重组后的新企业财务状况将产生直接影响。据
建设企业交易中心观察了解，近年来，企业并购重组交易数量和金额均呈较大幅度的增长，其中估值过高带来的财务风险尤为突出。
3、融资风险 并购重组主要有现金收购和发行股份收购两种方式，如全部以现金形式进行收购则需要大量的资金支持，因此大部分建筑企业一般会采取对外融资的方式来筹集资金，其方式有权益融资和债务融资两种。
权益融资的风险较小，目前市场中以这种方式支付对价占交易大多数，但大量发行股票可能会稀释每股收益，造成大股东的持股比例下降甚至丧失对上市公司的控制权。
债务融资的成本较低，资金利息可以税前扣除且不会造成对原有股东持股比例的稀释。但并购重组涉及的交易金额通常较大，如全部采用债务融资筹集资金，会造成资产负债率大幅上升，付息债务过高，资本结构恶化，从而带来严重的财务困难。
建筑企业并购重组的市场化改革正在逐步深化，企业应以公司总体发展战略为指引，根据实际情况采取恰当措施，以减少并购重组给企业带来的各项风险，以真正发挥“1+1>2”的并购重组效应。